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蓝星旗 蓝星旗 - 孤独的提纯纯合绿豌豆 全基因组HLA 分型

分享一个查询hla型分布频率的网站

http://www.allelefrequencies.net/hla6002a.asp?
效果如图：

wg官方要是能把这些信息直接加到报告就好了。还有DRB1为什么都是未检出啊，后续能更新出来吗？@chengang @xraywu @horinee
我买菁英版主要就是为了abo血型细分型和hla型，这方面信息丰富了一定能促进销量的
还有就是希望@菜哥 能发文科普下hla相关知识，比如有说hla型不相似的异性之间更有性吸引力，可hla型这么多，大部分人都不相似吧？还有求科普关于hla的连锁不平衡。

类似这样的文章：https://c1.m.ifeng.com/shareNews?fromType=vampire&forward=1&sfrom=pc&aid=sub_91904113
2019-02-23 • IP属地格鲁吉亚
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15 个回复

温暖的KIF4B基因
把排名在前面的外国都统统去掉，只看中国排名在前三的，结果如下：
1.云南哈尼族、云南布朗族、中国东南亚傣族
2.中国汉、河南、江苏汉族
3.云南布朗族、云南基诺族、云南佤族
4.江苏汉族、陕西、江苏汉族
5.云南布朗族、贵州水族、贵州布依族
6.陕西、北京、内蒙古
7.中国内蒙古东北亚匿名（其他地区0频率未上榜）
8.云南白族、丽江纳西族、哈尔滨满族
9.乌鲁木齐维吾尔族、江苏汉族、哈尔滨满族
10.未检出
 
 

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2019-02-24 • IP属地哈尔滨 • 评论 (1)
liunannyl

 再来个老父的，颤抖吧，吼吼！

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2019-02-24 • IP属地哈尔滨 • 评论 (7)
liunannyl

k23b凑齐了23成分，合理的推测是几代之前有穆斯林

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2019-02-24 • IP属地哈尔滨 • 评论 (1)
自信的TMTC1基因










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2019-02-24 • IP属地成都 • 评论 (1)
元月十号
怎么操作？看不懂 没有教程吗？汗。

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2019-02-24 • IP属地南京 • 评论 (3)
蓝星旗 - 孤独的提纯纯合绿豌豆
@liunannyl 好像没什么


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2019-02-24 • IP属地格鲁吉亚 • 评论 (11)
liunannyl

 
楼主你可以在gedmatch里看一下染色体构成，例如我染色体的这一段可以看出一些祖先确实曾经是穆斯林地区的人。红色是北非，黑色近东包括地中海和阿拉伯国家，蓝色高加索，棕色亚洲中部南部可能是阿富汗巴基斯坦附近。说明北非和地中海地区的穆斯林混过之后又和亚洲中南部穆斯林混过之后来的中国。

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2019-02-23 • IP属地哈尔滨 • 评论 (6)
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又试了下我姥姥的，除了欧洲还有一些，其他成分大幅度降低，或者没有了。奇怪的是也是有客家，闽南，只是比例低。另外还有内蒙东北部？感觉闽南，客家可能和中原有很大渊源才会出现的吧。

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2019-02-23 • IP属地郑州 • 评论 (1)
[已注销]
你觉得这个靠谱嘛？另外平静了，仔细看了看，国内出现最多的是乌鲁木齐维吾尔，好几次，其次是东南沿海2次，武汉2次，香港1次。

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2019-02-23 • IP属地郑州 • 评论 (2)
liunannyl
先前已报道HLA-C*06:02在欧洲与汉族人群中与银屑病相关，同时也是此次分析中MHC区域上显著关联性最强的位点（P=1.00×10−359），还发现了全新的独立相关等位基因HLA-C*07:04（P=1.77×10−44）。



无语，怎么还是这个，不看了。

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2019-02-23 • IP属地哈尔滨 • 评论 (0)
liunannyl
楼主你看一下文献。网站上查A*30:01这个组成汉族最高频单倍型的变异，在台湾人里频率是0%，在印度是16%。中文翻译的是汉族人，实际上英文原文的取样人群是有银屑病控制和发病的中国汉族人。
 
We thus sequenced the entire 5-Mb MHC region in 20,635 individuals of Han Chinese ancestry (10,689 controls and 9,946 patients with psoriasis) and constructed a Han-MHC database that includes both variants and HLA gene typing results of high accuracy.
 
 

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2019-02-23 • IP属地哈尔滨 • 评论 (2)
兰若兰若
求科普

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2019-02-23 • IP属地福州 • 评论 (6) • 发自微基因APP
liunannyl
 
在人口里分布挺随机的，好像没什么规律

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2019-02-23 • IP属地哈尔滨 • 评论 (18)
liunannyl
不错

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2019-02-23 • IP属地哈尔滨 • 评论 (0)
蓝星旗 - 孤独的提纯纯合绿豌豆
wg官方要是能把这些信息直接加到报告就好了。还有DRB1为什么都是未检出啊，后续能更新出来吗？@chengang @xraywu @horinee
我买菁英版主要就是为了hla型，这方面信息丰富了一定能促进销量的
还有就是希望@菜哥 能发文科普下hla相关知识，比如有说hla型不相似的异性之间更有性吸引力，可hla型这么多，应该大部分人都不相似啊，相似的才是少数吧？到底什么叫相似、不相似呢？还有求科普关于hla的连锁不平衡。

类似这样的文章：https://c1.m.ifeng.com/shareNews?fromType=vampire&forward=1&sfrom=pc&aid=sub_91904113

赞同来自: sslove1988

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2019-02-23 • IP属地格鲁吉亚 • 评论 (2)

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