微基因的HLA分型太粗糙，于是我用第三方工具再做了一遍

这下可以得到6位精度的HLA分型了，read count > 50的都能分出来。
工具：arcasHLA，你还需要bwa, samtools等等等
硬件：最好核多内存大，例如我有256G内存，28核cpu，还需要足够快的硬盘。
 
有谁缺少HLA报告的可以自己做。
 
[alignment] Observed HLA genes:
                gene          abundance    read count    classes
                HLA-A             0.07%           175        104
                HLA-B             0.06%           140        103
                HLA-C             0.06%           153        101
                HLA-DMA           0.12%           209          3
                HLA-DMB           0.13%           237          3
                HLA-DOA           0.13%           214         26
                HLA-DOB           0.16%           291         10
                HLA-DPA1          0.11%           188         28
                HLA-DPA2          0.13%           211          7
                HLA-DPB1          0.10%           178         97
                HLA-DPB2          0.11%           186         10
                HLA-DQA1          0.09%           154         40
                HLA-DQA2          0.10%           164         19
                HLA-DQB1          0.16%           281         89
                HLA-DRA           0.11%           189          8
                HLA-DRB1          0.11%           197         33
                HLA-DRB2          0.04%            49          1
                HLA-DRB3          0.04%            66          7
                HLA-DRB4          0.04%            74         11
                HLA-DRB5          0.00%             1          1
                HLA-DRB7          0.04%            72          1
                HLA-E             0.08%           202         37
                HLA-F             0.09%           197         13
                HLA-G             0.09%           207         39
                HLA-H             0.02%            49         12
                HLA-HFE           0.12%           271          1
                HLA-J             0.08%           199          9
                HLA-K             0.04%            88         21
                HLA-L            65.88%        160367          2
                HLA-N             0.02%             6          1
                HLA-S             0.07%            40          4
                HLA-T            31.28%         31887          3
                HLA-U             0.00%             2          2
                HLA-V             0.06%            74          3
                HLA-W             0.25%           519         19
                HLA-Y             0.01%            14          3