为什么X染色体测出来有AG，GG这种组合?

普通染色体对是两条性状相同的染色体对组合而成,有等位基因，所以检测数据中有AT,GG,AG等各种组成.
但X染色体就自己一条，在另一条Y染色体上不存在等位基因,怎么测出AG，GG这种的？应该就是A或者G吧？